Outils – Courbe de survie de Kaplan-Meier

Mode d’emploi

À quoi sert ce module

Ce module permet de produire une estimation Kaplan-Meier à partir d’un tableau simple, avec ou sans groupe de comparaison.

Format attendu

Le tableau doit contenir au minimum :

• une variable de durée ;
• une variable d’événement ;
• éventuellement une variable de groupe.

Le codage le plus simple est :

• 1 = événement observé ;
• 0 = censuré.

Qu’est-ce qu’une censure ?

Une observation est dite censurée lorsque l’événement étudié n’a pas été observé pendant la période suivie, sans que l’on puisse conclure qu’il ne surviendra jamais.

Autrement dit, la trajectoire est connue jusqu’à un certain moment, puis s’arrête sans événement observé à cette date. Une censure n’est donc ni un événement, ni une simple donnée manquante.

Comment utiliser l’outil

1. Collez un tableau ou importez un fichier CSV, TSV ou TXT.
2. Vérifiez le mapping proposé pour la durée, l’événement et, si besoin, le groupe.
3. Contrôlez la structure de survie.
4. Si la validation est positive, lancez le calcul Kaplan-Meier.

Exemple minimal

Vous pouvez tester l’outil avec ce tableau :

time,status,group
5,1,A
8,0,A
12,1,A
4,1,B
7,0,B
10,1,B

Comment lire l’exemple

Dans cet exemple, les groupes A et B contiennent chacun trois observations. Le code 1 signale un événement observé. Le code 0 signale une censure.

• dans le groupe A, un premier événement survient au temps 5, une censure est observée au temps 8, puis un second événement au temps 12 ;
• dans le groupe B, un premier événement survient au temps 4, une censure au temps 7, puis un second événement au temps 10.

Comment lire le graphique

• la courbe part de 1, soit 100 % de survie estimée au départ ;
• elle baisse seulement lorsqu’un événement observé survient ;
• une censure ne fait pas chuter, à elle seule, la courbe ;
• plus la courbe descend tôt, plus les événements surviennent tôt dans le groupe considéré ;
• si plusieurs groupes sont affichés, leur comparaison reste ici descriptive.

Dans l’exemple proposé, le groupe B connaît son premier événement plus tôt que le groupe A. Les deux groupes atteignent ici une survie estimée nulle, mais pas au même moment. Cela décrit une différence de calendrier observé. Cela ne constitue pas, dans cette version, une preuve statistique formelle d’écart entre groupes.

Lecture minimale des résultats

• la table Kaplan-Meier indique les temps d’événement, le nombre d’observations encore à risque, les événements observés, les censures et la survie estimée ;
• la médiane de survie correspond au premier temps où la survie estimée atteint 0,5 ou moins ;
• si ce seuil n’est pas atteint, la médiane n’est pas calculable dans les données observées.

Cas à éviter

N’utilisez pas ce module pour :

• une simple série temporelle ;
• une évolution descriptive sans événement défini ;
• une rétention non documentée comme structure de survie ;
• des données où l’on ne distingue pas clairement événement et censure.

Limites de cette version

• aucun test de log-rank n’est fourni ;
• aucun intervalle de confiance n’est affiché ;
• la comparaison entre groupes reste interprétative et descriptive ;
• la présence de plusieurs courbes ne démontre pas, à elle seule, une différence statistiquement établie.